2001年，正在主持西藏三大文物保護維修工程項目壁畫文物的保護與修復工程總負責人敦煌研究李最雄研究員致信時任西藏自治區(qū)黨委副書記、政府常務副主席的郝鵬，提出了在西藏成立一所文物保護科研單位，結束西藏沒有專門的文物保護科研機構的歷史。

在自治區(qū)的高度重視和西藏自治區(qū)文化廳黨組、文物局的積極努力下，2005年，西藏自治區(qū)機構編制委員會正式同意成立西藏自治區(qū)文物保護研究所，并明確了單位的主要職責。成立之后的西藏自治區(qū)文物保護研究所職責定位為貫徹執(zhí)行國家文物保護工作的方針政策和法律法規(guī)；承擔自治區(qū)境內的古建筑維修工程勘察設計、研究工作；負責自治區(qū)境內出土文物、館藏文物局部分不可移動文物的科技保護工作；負責自治區(qū)境內的地上、地下文物的考古、調查、發(fā)掘、研究工作；負責有關文物、考古資料的收集、整理、保護工作及承擔自治區(qū)文物局交辦的其他事項。

2006年，文化廳黨組研究決定哈比布等9名同志調任到西藏自治區(qū)文物保護研究所工作。經過三年的積極籌備，2007年年底，基本具備了能夠獨立承擔展開文物考古相關工作的能力和條件。

西藏文物保護研究所簡稱“西藏文研所”，是西藏自治區(qū)文物局六個直屬單位之一，正處級全額事業(yè)單位。目前在編人員20名，配置一正兩副所長職位。下設辦公室、考古研究室、文物保護研究室。

西藏自治區(qū)文物保護研究所的成立，結束了西藏沒有獨立的文物保護科研機構的歷史，是在大力推進西藏文物事業(yè)發(fā)展進入新常態(tài)化過程中的重要里程碑，為促進西藏文物事業(yè)的更好更快發(fā)展，全面提升西藏經濟社會跨越式發(fā)展和建設中華民族特色文化保護地的服務能力提供強有力的保障。