1978年10月成立民族宗教研究室，1996年6月改為青海省社會科學(xué)院民族宗教研究所。屬青海省社會科學(xué)院具有地方特色的優(yōu)長學(xué)科研究機構(gòu)之一。先后有22名研究人員在所內(nèi)工作。歷任所長：劉醒華、蒲文成、穆興天、馬連龍；歷任副所長：蒲文成、拉毛扎西、穆興天、呂建福、拉毛措、馬連龍；現(xiàn)任副所長鄂崇榮。現(xiàn)有研究人員6名，由藏、回、土、撒拉、蒙古族五個民族組成，其中副研究員3人、助理研究員1人、研究實習(xí)員1人、助理圖書館員1人。

該所以世居青海的藏族、回族、土族、撒拉族、蒙古族5個少數(shù)民族為主要研究對象，研究其各種文化現(xiàn)象以及相關(guān)的民族宗教理論和民族宗教問題。

多年來該所在民族歷史、民族文化、民族理論與政策、藏傳佛教、秘密佛教、伊斯蘭教、民間信仰、宗教與現(xiàn)代社會相適應(yīng)等領(lǐng)域成果豐碩。共承擔(dān)中華社科基金課題10項，省社科基金課題10項，委托課題15項。先后進(jìn)行了我國藏族聚居區(qū)社會歷史、宗教和藏傳佛教教派、我省農(nóng)牧區(qū)民間信仰與兩個文明建設(shè)、1996年全省宗教大調(diào)研、1999年全省民族問題大調(diào)研、2003年中國少數(shù)民族現(xiàn)狀與發(fā)展調(diào)查、三江源區(qū)生態(tài)保護與建立生態(tài)補償機制以及回族教育問題等大型調(diào)研工作。至2010年共出版專著、譯著44部，發(fā)表學(xué)術(shù)論文和調(diào)查報告330多篇，資料及其他成果17種，文字總量約960多萬字。主要專著有《中國密教史》、《歷輩達(dá)賴?yán)锱c中央政府的關(guān)系》、《覺囊派通論》、《甘青藏傳佛教寺院》、《塔爾寺概況》、《藏傳佛教與藏族社會》、《青海少數(shù)民族》、《大日經(jīng)研究》、《批判精神》、《章嘉國師傳》、《藏密溯源》、《藏文化與藏族人》、《文化嬗變與價值選擇》、《土族民間信仰解讀——地方性信仰與儀式的宗教人類學(xué)研究》等；合作編寫《藏文古體詩格舉例匯編》、《青海藏傳佛教寺院明鑒》、《歷代達(dá)賴?yán)锱c班禪額爾德尼年譜》、《青海百科大辭典》、《佛教二百題》、《中國百縣市調(diào)查·湟中卷》、《青海藏族人口》、《中國民族人口（二）》、《鄧小平民族理論與實踐》、《藏族生態(tài)文化》、《西北少數(shù)民族文化專題研究》、《鏡鑒－青海民族工作若干重大歷史事件回顧》、《中國少數(shù)民族現(xiàn)狀與發(fā)展研究叢書·互助縣·土族卷》、《中國少數(shù)民族現(xiàn)狀與發(fā)展研究叢書·瑪沁縣·藏族卷》、《中國少數(shù)民族村寨調(diào)查·土族卷·大莊村》等；主要譯著有《七世達(dá)賴?yán)飩鳌贰ⅰ读腊喽U洛桑巴丹益希傳》、《佑寧寺志》、《如意寶樹史》（合作）、《西藏簡明通史》《夏瓊寺志》等；參加了《中國各民族宗教與神話大辭典》、《青海百科全書》、《青海百科大辭典》、《藏族大辭典》等20余部書籍的撰寫工作。共有30多項成果獲省部級以上獎勵，其中獲中宣部“五個一工程”入選作品獎1項，獲省部級優(yōu)秀科研成果一等獎1項、二等獎10項、三等獎10項、優(yōu)秀獎1項、鼓勵獎8項。另有1篇入選中宣部等七部委舉辦紀(jì)念中國共產(chǎn)黨成立90周年理論研討會論文集，1項成果獲全國青年優(yōu)秀社會科學(xué)成果優(yōu)秀獎，有16篇論文獲優(yōu)秀論文獎。

在搞好具有青海地方特色和民族特色基礎(chǔ)理論研究的基礎(chǔ)上注重現(xiàn)實問題研究，為青海經(jīng)濟社會發(fā)展和省委省政府決策提供智力支持。從2000年至今，共完成現(xiàn)實應(yīng)用對策方面的研究成果30余項，有26項成果獲得中央統(tǒng)戰(zhàn)部和省委省政府領(lǐng)導(dǎo)批示肯定。

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