復旦大學歷史地理研究中心成立于1999年6月，前身是成立于1957年，由我國歷史地理學奠基人、著名歷史地理學家和歷史學家、已故中國科學院院士譚其驤教授創辦的復旦大學歷史系中國歷史地理研究室。1982年6月，經教育部批準，在研究室基礎上建立中國歷史地理研究所。1981年被確定為首批碩士、博士學位授予點。1987年被國家教委確定為全國首批重點學科。1999年，教育部首批人文社會科學重點研究基地——歷史地理研究中心成立。2005年，歷史地理研究國家哲學社會科學創新基地正式掛牌。

作為目前國內專職人員最多、門類最全、總體水平最高、實力最強的中國歷史地理專門研究機構，本所擁有一批國內公認的學科帶頭人，梯隊結構比較合理，研究涉及歷史人文地理和歷史自然地理的各個方面。復旦大學歷史地理研究中心中心主任現由張曉虹教授擔任。歷史地理研究中心現共有研究人員27名，行政人員5人。其中教授16名，副教授9名，講師2名，26人具有博士學位。

復旦大學中國歷史地理研究所在譚其驤先生等老一輩學者的言傳身教下，素以學風嚴謹著稱。自成立以來，總體學術水平長期處于國內第一的地位，其骨干均為各分支學科的學術帶頭人，尤其是在疆域政區、水道變遷、地名考證、歷史地圖的研究和編繪、歷史地理古籍整理、歷史氣候和災害等方面一直處于學科前沿。近年來在中國歷史地理信息系統、歷史人口地理、移民史、歷史政治地理、歷史文化地理、歷史社會地理等人文地理分支學科又有了很大的發展。

在人材培養方面，1960年研究室創建歷史地理專業，于1960-1962年連續招收了三屆共52名歷史地理專業本科生。1983年8月，本所研究生周振鶴、葛劍雄在譚其驤先生指導下完成博士論文并通過答辯，成為全國首批兩名文科博士。到目前為止，本所共有5篇“全國百篇優秀博士論文”,占復旦大學文科之半，居全國歷史學科首位。此外，還有4篇博士論文獲得全國優秀博士論文提名。目前，本所每年在讀的博士研究生和碩士研究生近百人，畢業生已遍布全國各地，為歷史地理學人才的培養做出了重要貢獻。

《歷史地理》輯刊是中國地理學會歷史地理專業委員會主辦的一本全國性學術刊物，由復旦大學歷史地理研究所負責編輯。1981年創刊，由上海人民出版社連續出版。《歷史地理》主要刊載歷史地理及相關領域理論、方法以及實踐等方面的學術論文。

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