中國第二歷史檔案館是集中典藏中華民國時期（1912—1949）歷屆中央政府及直屬機構檔案的中央級國家檔案館，館藏總量為225萬余卷，約 4500萬件。館址在南京市中山東路309號，原為“中國國民黨中央黨史史料陳列館”舊址，由我國著名建筑大師楊廷寶設計，于1936年建成。檔案庫房、閱覽大廳和業務大樓等建筑均為1950年代后仿照宮廷建筑風格相繼建成。

為集中管理國民政府遺留在南京的檔案，1951年2月1日中國科學院近代史研究所南京史料整理處成立，其后又從成都、重慶、昆明、廣州和上海等地接收了大量國民政府中央機構的檔案，奠定了館藏檔案的基礎。1964年4月，南京史料整理處改隸國家檔案局，更名為中國第二歷史檔案館，由郭沫若先生題寫了館名。

中國第二歷史檔案館設有保管處、利用處、整理編目處、史料編輯處、研究室（民國檔案雜志社）、技術處、信息化處和全國民國檔案資料目錄中心等業務機構，專門從事民國檔案的收集、保管、保護、整理、編目、接待利用和編研出版等工作，結合縮微復制、數字化掃描等手段，對館藏檔案進行研究、開發與利用。

編輯出版了包括中華民國史檔案資料匯編、叢刊、叢書在內共140余種上億字的檔案史料，其中與藏事有關的有《西藏地方是中國不可分割的一部分》（西藏人民出版社1986年版）、《十三世達賴圓寂致祭和十四世達賴轉世坐床檔案匯編》（中國藏學出版社1991年版）、《九世班禪致祭和十世班禪坐床檔案選編》（中國藏學出版社1991年版）、《九世班禪內地活動及返藏受阻檔案選編》（中國藏學出版社1992年版）、《黃慕松、吳忠信、趙守鈺、戴傳賢奉使辦理藏事報告書》（中國藏學出版社1993年版）、《元以來西藏地方與中央政府關系檔案匯編》（中國藏學出版社1994年版）、《民國治藏行政法規》（五洲傳播出版社1999年版）、《康藏糾紛檔案選編》（中國藏學出版社2000年版）《中國第二歷史檔案館所存西藏和藏事檔案目錄(上下冊)》（中國藏學出版社2000年）等，目前正與中國藏學研究中心合作編輯《中國第二歷史檔案館館藏西藏及藏事檔案匯編》（已經由中國藏學出版社出版50冊）。

創辦了《民國檔案》雜志。接待了包括港、澳、臺在內的全國各地和美、日、英、法、德等國家的中外查檔者60萬人次以上。

經過幾代檔案工作者的努力，民國檔案在存史資政、服務社會等方面發揮出了愈加顯著的作用。

中國第二歷史檔案館館藏檔案卷帙浩繁，共收藏有1354個全宗（保管單位），基本館藏225萬余卷（宗）。此外，還收藏有民國時期圖書期刊資料約7萬冊。

（一）南京臨時政府和南方革命政權檔案

辛亥革命推翻帝制，建立民國。1912年1月1日，孫中山在南京建立中華民國臨時政府。南京臨時政府僅存92天，所形成的檔案數量較少，其后又歷經輾轉，頗有散失?，F在館藏僅有百余卷，但內容極為珍貴，其中有不少孫中山親筆批示和簽發的文件，具有極高的歷史價值。袁世凱當政后，孫中山又領導了南方革命運動。從1917年孫中山在廣州成立護法軍政府至1927年寧漢合作，南方革命政權所形成的檔案，雖幾經輾轉，散失甚多，但本館仍保存近700卷。

（二）民國北京政府檔案

1912年3月，袁世凱在北京建立了民國政府。自袁世凱起，中經黎元洪、段祺瑞、徐世昌、馮國璋、曹錕等，直到1928年6月張作霖退出北京止，民國北京政府當政的16年間形成了為數甚多的檔案。民國北京政府瓦解后，南京國民政府接收了相關檔案，并在北京專設機構保管，其后又陸續將這部分檔案南遷。由于連年戰亂，這部分檔案遭受人為和自然的損壞十分嚴重。但經本館多年悉心收集和整理，目前已達66個全宗。

（三）南京國民政府檔案

南京國民政府從1927年成立，統治中國長達22年。在此期間形成的檔案，不僅數量眾多，而且內容豐富，除部分被國民政府移往臺灣，以及遭受損毀和流失外，大部分均為本館收藏。這部分檔案共計710個全宗。包括國民政府（總統府）、五院、各部及其所屬軍事、經濟、財政、金融、資源、工礦、貿易、教育、科研等機構以及黨派社團的檔案，是為館藏檔案的主體。

（四）日偽政權檔案

1931年“九一八”事變后，日本大舉侵華，并在淪陷區先后成立了若干個偽政權，這些日偽政權形成的檔案，主要是汪精衛政權形成的檔案，共計102個全宗，較為完整地反映了日偽對淪陷區的殘酷統治和日本對中國進行大肆掠奪的歷史狀況。

（五）特藏檔案

本館自1980年代末開始對珍貴歷史檔案進行特藏保護，設置了500平方米的特藏檔案庫，典藏著從館藏檔案中精選出的1萬余卷珍貴檔案。其主體為民國政要個人檔案，如孫中山、蔣介石、宋子文、馮玉祥、蔡元培、張靜江、丁文江、顧維鈞、郭泰祺等特藏檔案共64個全宗。此外還有勛章、印章、股票、鈔票、郵票、商標、字畫、碑拓、家譜和照片、圖片、唱片等不同形式，它們兼有檔案與文物雙重屬性，是彌足珍貴的歷史瑰寶。

來源：http://www.shac.net.cn/中國第二歷史檔案館網站，內容有增加